La historia se centra en los hermanos Durie, James (el señor de Ballantrae) y Henry, cuyos destinos se ven marcados por la Guerra de los Cien Años y la rebelión jacobita de 1745. Para salvaguardar los intereses de la familia, los hermanos deciden dividirse: James se une a la causa jacobita mientras Henry permanece leal al gobierno británico. Sin embargo, las decisiones tomadas durante la guerra solo alimentan una enemistad mortal entre ambos.

James, el mayor, es carismático, aventurero y manipulador, mientras que Henry, más reservado y responsable, asume el control de la familia. Tras la aparente muerte de James, Henry trata de seguir adelante, pero el regreso de su hermano, que todos creían muerto, desencadena una serie de enfrentamientos y traiciones que desestabilizan a la familia y los llevan por un camino de tragedia.

Stevenson no solo presenta una historia de aventuras, sino también una reflexión profunda sobre la naturaleza del odio, los celos y la lucha interna entre el bien y el mal que existe en cada persona. Los paisajes escoceses, los piratas y los viajes a tierras lejanas añaden un carácter épico a la narración, pero el núcleo de la novela reside en la compleja relación fraternal y en el análisis de sus personalidades.

"El señor de Ballantrae" es una novela más oscura y psicológica en comparación con otras obras de Stevenson, como "La isla del tesoro", pero sigue siendo una emocionante historia de aventuras y tragedia familiar, perfecta para los lectores que disfrutan de historias con personajes profundos y conflictos morales.